隋末時期，天下大亂，群雄逐鹿，唐國公李淵也在太原起兵，當時李淵身邊能打仗的，除了李建成和李世民兄弟兩，還有李淵的堂侄李孝恭，李孝恭與李世民是堂兄弟，李孝恭的祖父李蔚是李虎的第七子，李世民的祖父李昺則是第三子，李虎的老大和老二戰死，唐國公的爵位就由李昺繼承。
李淵在太原起兵，攻佔長安後，命令侄子李孝恭為山南招尉大使，負責平定巴蜀地區，李孝恭也沒有辜負李淵對自己的期望，沒費多大的力就平定了巴蜀三十多個州，還活捉了吃人狂魔朱璨。
當時部下都勸李孝恭殺掉朱璨，李孝恭沒有同意，兵家講究攻城為下，攻心為上，李孝恭覺得如果殺掉朱璨，那些想要投降的人就會有顧慮，如果讓其他人知道，像朱璨這樣的人都能得到赦免，其他人就不戰而降了。
平定巴蜀，戰敗朱璨只是李孝恭功勞中的一件，真正立下了汗馬功勞的是他統一南方地區，有人說北方是李世民，南方是李孝恭，就連戰神李靖，徐茂公（李勣）都在他麾下聽從指揮。
當時李淵面臨的兩大敵人，南方蕭銑，洛陽王世充，打誰都不好，打王世充的話，怕蕭銑來摘桃子，打蕭銑又怕王世充摘桃子。
李世民帶著李勣攻打王世充，李孝恭帶著李靖攻打江南蕭銑，唐軍與蕭銑的艦隊在江中交戰，李孝恭大敗蕭銑之後，唐軍得了許多戰船，但李孝恭並沒有直接把這些戰船收歸唐軍所用，而是把這些船棄於江中，順流而下。
眾將領都不理解他的做法，李孝恭說，蕭銑的領地，南至嶺表，東達洞庭，地勢險要戰士眾多，如今蕭銑沿江鎮守將士眾多，如果我軍未攻下城池，而蕭銑的援兵到來，那麼我軍就會內外交困，舟船雖多，又有何用，現在蕭銑已敗，不會馬上進兵，他會往返打聽情況，這樣就可延緩他的救兵救兵，這樣就有利於我軍順利地攻下江陵了，不久蕭銑救兵到達巴陵，見空船，果然遲疑不進。
李孝恭圍困蕭銑後，蕭銑自知已無力迴天，於是便向李孝恭投降，讓李孝恭答應他，只殺他一人，而不殺全城軍民百姓，李孝恭把蕭銑押送回長安，李孝恭的仁義在南方有很高的威望。
有人說李孝恭是被神隊友李靖帶飛，李靖的軍事能力，這個是沒說的，李孝恭為主帥，李靖為其參謀，實際上是李靖行使全軍統帥的權力，李孝恭是名義上的統帥，如果李孝恭是無能之輩，任憑李靖有多神，也無法戰勝蕭銑。
輔公佑反叛，李孝恭再次出兵討伐輔公佑，麾下有李靖、李勣等人，軍隊剛要出發之時，李孝恭與諸軍飲壯行酒的時候，突然，杯中酒出現了血色，在座的眾將都面驚失色。
李孝恭舉止自如，從容不迫的說，禍福無門，惟人所招，我沒做什麼虧心事，諸位不必為我如此憂心，輔公祏惡貫滿盈，如今依仗朝廷威靈以問罪致討，杯中之血，乃是賊臣授首的徵兆而已，於是一口飲盡杯中血水，眾將這才心安
輔公佑派遣大將馮惠亮出兵挑戰李孝恭，李孝恭堅守不出，派遣奇兵斷了敵軍糧道。又故意派老弱病殘挑釁馮惠亮，命盧祖尚派精銳騎兵埋伏，馮惠亮中計，大敗退守梁山，李孝恭率主力趁機攻取輔公佑的地盤。輔公佑逃跑，被李孝恭生擒。
平定蕭銑和輔公佑，都體現出了李孝恭的大將之風，位列凌煙閣二十四功臣第二，並不單單只是因為皇族的關係。
李孝恭平定江南以後，任揚州大都督，實際上已經是整個江南權力最大的人，而且手上又握有兵權，不久就有人誣陷他謀反，於是李淵把他調離江南，歷任涼州都督，晉州刺史。
其實就算是自己的侄子，李淵也擔心，因為李孝恭在南方的名望太高了，被解除兵權時李孝恭也才三十幾歲，他也明白叔叔李淵的心，所以後期的國家戰事基本上就沒了他的身影，乾脆做個平安王爺，蓋一座大房子，找了一百多個美女，夜夜狂歡。
玄武門之變的時候，他也沒出現，以他的聰明才智，不管你兄弟兩怎麼爭，我不參與，王位是不會有變的，而且當時李建成李世民兄弟也不敢拉攏他，萬一他在南方振臂一呼，那就是三兄弟爭江山了。
一百多個美女天天陪著，可能是玩得太嗨，就暴斃了。
