繼假面騎士Black消滅戈魯戈姆戰鬥後半年，本應取回和平的地球卻突然被怪魔界克萊西斯帝國入侵。克萊西斯帝國知道地球上有假面騎士BLACK，所以他們還是對假面騎士有所顧忌。
克萊西斯帝國的賈古克將軍一開始想招安南光太郎作為部下，但被南光太郎拒絕後。在變身機能破壞的情況下，被扔往宇宙將變為宇宙塵埃的時候，神秘的太陽光線照往南光太郎，使得他體內的帝王石產生變化，成為新生的光之王子——“太陽之子”假面騎士Black RX
克萊西斯帝國作為該劇的反派組織，不同帝國形式存在起科技和文明可想而知。而克萊西斯帝國雖然是處在怪魔界，但它卻是地球在另一次元的影子。和地球相當於姐妹兄弟般的存在。只要地球一直存在，克萊西斯帝國就算被消滅，它也會一直存在怪魔界。
1000年前，克萊西斯皇帝在被稱為“地球之影”的異次元世界的怪魔界設立了一個獨裁國家。但是因為超科學的文明發展，克萊西斯被汙染而遭受沙漠化等環境破壞，於是克萊西斯皇帝決定消滅人類並將50億克萊西斯人移民到地球，在日本建立了戰略基地。為了將地球變成第二個怪魔界，於是便將他們的要塞基地停落於異次元空間，準備進行周長的計劃。並對地球做了詳細的調查。
當他們知道地球上的南光太郎是改造人假面騎士BLACK後，他們根據情報發明出了能控制並能破壞光太郎變身的光線。這種光線能束縛光太郎無法變身假面騎士，劇中妖魔你瑪麗巴籠曾對光太郎說過要是光太郎願意接受招安的話，他會給光太郎比BLACK強3倍的力量；由此可見克萊西斯科技技術很高。之後，瑪麗巴籠復活了前做死在戈魯戈姆神殿裡的影月來對付RX,可見他們的能力非同小可。
但他們低估了光太郎體內帝王石的力量。當他們把光太郎丟入怪魔界執行死刑的時候，光太郎體內的帝王石產生新的力量，讓光太郎起死回生的同時，假面騎士BLACK也進化成為RX。
克萊西斯帝國裡，克萊西斯皇帝為最高領導者，曾化身檢察官達斯馬達到克萊西斯戰艦上監督傑克將軍和其他四大幹部作戰。
賈古將軍為四大幹部領導者，是作戰的前線先鋒指揮官
四大幹部（四大天王）乃是：
怪魔妖族 諜報參謀 瑪麗巴羅
怪魔獸人 海兵隊長 波斯剛
怪魔機器人 機甲隊長 加迪森
怪魔異生獸 牙隊長 蓋多利昂
四大幹部常會想要搶功而爭先奪後對方RX，其四人並不團結。
因為對付RX一直屢戰屢敗，克萊西斯帝國皇帝想要懲罰幾人，不想幾人竟拿怪魔異生獸 牙隊長 蓋多利昂去做替死鬼，可見幾人只見有歧視自己同事的行為。但瑪麗巴籠和加迪森似乎有一腿............
克萊西斯皇帝說出克萊西斯帝國毀滅的原因是因為地球受到了嚴重汙染，處於地球另一側的克萊西斯帝國因此受到影響而毀滅。然而事實是克萊西斯殘暴的統治導致克萊西斯沙漠化，瀕臨滅亡。
克萊西斯帝國比起前作BLACK裡的上古邪惡社戈魯戈姆來說，實力要強上很多。畢竟他是一個擁有高度文明的帝國。但戈魯戈姆的創世王擁有支配宇宙的力量，所以二者PK的話，勝負真不好判斷。
克萊西斯帝國
創世王
