《盜墓筆記》的故事圍繞著一個詞——“終極”。終極是什麼？自上古時代的西王母、周穆王開始，東北張家、魯殤王、東夏萬奴王、汪藏海、“它”等等等一直到現代，他們追求的是長生，還是終極？終極就是長生嗎？終極就在青銅門之後，陳文錦、張起靈曾看過終極，但是他們說，終極，就是終極。
終極，就是終極。只有步入青銅門後，親自目睹，才能明澈。就是為了這個說不出的終極，有了無數人的苦苦追尋。故事直到現在，吳邪、張起靈、王胖子組成了鐵三角，一起探尋著這歷經數千年的重重迷霧。
老九門
老九門是《盜墓筆記》最重要的一個勢力，三代都與終極有關。
老九門是老長沙的九個盜墓世家，勢力最為強大。這九門分別是張啟山、二月紅、半截李、陳皮阿四、吳老狗、黑背老六、霍仙姑、齊鐵嘴、解九爺，張大佛爺是老九門之首，出身於東北張家，正是如此，才有了四姑娘山那次“史上最大倒鬥活動”。這次倒鬥是老九門聯手，張起靈是領頭人，集結了所有好手，也是這次成了老九門的災難。這次倒鬥之後，老九門分成兩派，一派將失敗的原因怪罪到張起靈的身上，而霍仙姑、吳老狗等人曾被張起靈救過的就堅決擁護張起靈。
故事開始時，老九門已經基本無人，但他們的影響還在。自當年倒鬥失敗，吳老狗萌生退意，他的大兒子吳一窮正式漂白，老二吳二白半隻腳在其中，只有吳三省重操舊業。而解九爺沒有逃避，他一直在對抗，巴乃考古隊就是被解九爺的人替換，最後他逃到杭州被吳老狗暗中保護，並把隨身攜帶的一個秘密掩埋到了吳三省新宅子之下。至於正面出現的陳皮阿四和霍仙姑，陳皮死在了雲頂天宮，霍老太則是死在了張家古樓。
老九門第一代雖然失敗，但事情遠遠沒有結束，老九門的第二代和第三代已經被暗中選為二三梯隊培育了。第二代則是吳三省、陳文錦、霍玲、齊羽、李四地等這一批人，這些新興力量全部在旋渦之中。
老九門沒落後，第二次考古隊啟動。陳文錦帶考古隊（張大佛爺的張家人和部分九門後人）去巴乃考古，實際上是送葬，被盤馬所殺，又被解九爺的人替換，只有陳文錦、霍玲少數幾個人倖存。假的考古隊一路帶著屍體開始逃亡，在吳老狗的幫助下把屍體藏在吳三省的宅子之下。一路混入組織內部，開始毀壞資料，殺死或替換關鍵人員，同時解九爺的內應也調出了倒鬥後失去記憶的張起靈。此時，解九爺感到事情沒那麼簡單，派了考古隊前去西沙，陳文錦和霍玲把假文錦和霍玲調到了長白山，跟著去了西沙。也是這次吳三省進入了旋渦，在海底墓解連環托出了所有計劃，兩人制定了更加大膽的計劃，要完全毀掉組織的核心層。於是，解連環帶上了吳三省的面具，真吳三省則把考古隊迷暈交給解家的船送給了組織，進入了療養院。在這期間真文錦她們因為誤食海底墓的丹藥，身體發生了異常，從療養院逃出後，她們已經不信任任何人了，開始自己尋找真相，並建立了錄影帶機制，開始警告第三代。在所有的博弈中，所有人都是冷血無情的，只有文錦和霍玲想的還是保護。
到了老九門的第三代，老九門已經徹底沒落了，吳家和解家成了代表。第三代的主要人物是吳邪、解雨臣、霍秀秀，他們依然在這旋渦之中。
鐵三角
故事正式開始的主角是吳邪、張起靈、王胖子，他們一直在旋渦中追尋著。
吳邪是吳老狗的孫子，吳三省的侄子，老九門中的吳家獨子。大學畢業後，吳邪在杭州西泠社開著一家古董店，普通平靜，金萬堂帶著戰國拓本進入他的小店，他的一生就此改變了，陷入了那老一輩人織成的迷霧混雜陰謀的網。自打七星魯王宮開始，鐵三角正式相遇，他們一起去過西沙海底墓、雲頂天宮、西王母國、四姑娘山、張家古樓。越是經歷得多，吳邪越是想弄清楚真相，他執著地去追尋所謂的答案，但到最後答案已經毫無意義，他卻已經不能回頭。
張起靈是鐵三角的靈魂，是一個強大的如同神佛一樣的人物。事實上，張起靈並不是一個名字，張家的歷代族長都叫“張起靈”，小哥是張家的最後一任族長。張家是個存在很久的神秘家族，世代守護著長白山青銅門和“終極”的秘密，這也是小哥的使命，此時的張家已經沒落，他不得不找老九門合作，擔任了那次倒鬥活動的領頭人。那次活動失敗後，張起靈也失憶，這是張家為確保純正“麒麟血”的傳承實行內部通婚制度易患的失魂症，張起靈曾幾度患病，他一直在尋找記憶和線索，在延續千年的迷局中摸索前行。故事正式開始後，解連環夾喇嘛讓陳皮阿四手下的張起靈一起前去倒鬥，並拿出當年繳獲的黑金古刀作為試探，這也是鐵三角組隊的開始。其後，鐵三角一起經歷了很多，神秘的是張起靈和吳家三代人都有著交集，而可怕的是吳老狗都去世了，張起靈還是當年的年輕模樣。
王胖子自稱是北派摸金校尉，在沒遇見吳邪、張起靈前經常單獨行動。雖然胖子平時看著大大咧咧不靠譜，在倒鬥時會手賤，但是他身手不凡，擅於使用列舉法，關鍵時刻沒掉過鏈子，而且他眼神毒辣，經常能發現一些重要的細節。不同於張起靈和吳邪，他們都身處迷霧混雜陰謀的網，一直在尋找答案，胖子不屬於張家也不屬於老九門，是一個遊離於迷局之外的人。據胖子所說他上過山下過鄉當過兵還支過邊，不過他這人喜歡吹牛，真實情況不好定，也有人懷疑胖子是“它”的人，不過胖子對吳邪、張起靈絕對是真心的，他們三個披荊斬棘經歷了太多。
阿寧
在《盜墓筆記》中還有著很多的人物，有潘子、黑瞎子、阿寧等人。潘子是吳三省的鐵桿粉絲，黑瞎子也是個神秘的人物，單單在《盜墓筆記》中描述不算多，至於阿寧是書中少有過多描述的女性角色。
阿寧是裘德考公司的人，精明能幹，身手也很強。在怒海潛沙卷阿寧登場，美豔而狡猾，擅長偽裝，在海底墓中觸發蓮花箭，拿吳邪當人肉盾牌去擋箭雨，想幹掉他們三人。再次出場是去塔木陀，在魔鬼城迷路時曾和吳邪相互依靠，隨後在塔木陀阿寧被野雞脖子咬傷中毒而死。阿寧的死實在是太快太突然太隨便了，而她被蛇咬後變成了半人半蛇的怪物似乎又有著什麼意義。
說實話，《盜墓筆記》看過好幾遍，人物關係還不能說完全理的清，只能說懂個大概。這也不是我們讀者的問題，是作者的線索太亂。再者，《盜墓筆記》後續系列太多了，各種長篇短篇，短文，以及三叔的訪談、回覆，實在是看不下去了。如此久的一個系列，很多情節根本無法串聯起來，有些地方前後矛盾，情節混亂，後期人物越來越多，小張哥，阿寧的弟弟薩沙，只是很多坑還是坑，感覺三叔都沒法完整的串聯起來。我看過最牛的一個解析是從中華文明的源頭開始，不過我感覺很多並不對，尤其是三叔寫了後續之後很多更是有問題，人物關係和故事前後串聯真的很混亂。這個真的和《鬼吹燈》不一樣，《鬼吹燈》所有人物、情節都是可以串聯起來的，《盜墓筆記》坑是太多了。
