光明網訊（記者 宋雅娟 張蕃）中國李是世界上商業化栽培最廣泛的李種之一，適應性強，具有較高的經濟價值與生態價值。近日，中國農業科學院鄭州果樹研究所李杏種質改良團隊與桃種質資源團隊聯合破譯了中國李高質量基因組，為其重要經濟性狀改良奠定遺傳學基礎，相關成果9月2日發表於《植物學雜誌（The Plant Journal）》。
據黃振宇博士介紹，研究團隊首先利用二代、三代及Hi-C等測序技術繪製了李杏種質改良團隊自主選育品種‘中李6號’基因組圖譜，其組裝質量為現有最優，為深度解析中國李基因組變異規律、分子育種及優異基因發掘奠定了重要基礎。
基因組註釋示意圖：Ⅰ~Ⅴ分別表示染色體長度，基因密度，重複序列密度，GC鹼基含量以及基因組內部共線性關係
在此基礎上，該研究又進行了全基因組高深度重測序資料分析，共鑑定到3,380,659個高質量SNPs，將74份中國李核心種質聚類為南、北、東北及國外品種群，發現南方品種群較為原始，遺傳多樣性豐富，且與其他品種群間存在基因交流，從遺傳學層面再次證實我國長江流域為中國李原始馴化中心。
中國李適應性極強，在我國南至廣東省、北至黑龍江省，均有大面積栽培，但關於其適應性機制鮮有報道。研究對不同品種群間進行選擇壓分析，共鑑定到35個受選擇位點，其中，開花調控、抗病抗逆及類黃酮代謝等重要途徑關鍵基因顯著富集，此外，基因家族的擴張和收縮分析表明，以上幾類基因家族在基因組進化過程中顯著擴張，初步揭示了中國李重要性狀馴化的分子基礎，為後續發掘中國李適應性相關優異基因提供重要參考。
據瞭解，該研究得到國家重點研發計劃、中國農科院科技創新工程等專案的資助。
來源： 光明網
