北京協和醫學院是衛生部唯一一所直屬高校，學校創辦於1917年，它是最早開啟我國八年制臨床醫學教育和高等護理學教育的高校。在醫學類高校甚至是醫學界都有獨特的影響力，該校實行“院校合一”的管理體系，是我國唯一的國家級醫學科學學術中心和綜合性科學研究機構。
長期的辦學過程，北京協和醫學院有自己獨特的辦學風格，雄厚而系統的科研實力，全面精湛的臨床醫療能力，八年制醫學博士是該校的特色，八年制臨床醫學始終堅持小規模招生，分段教學，導師制培養模式。如今的北京協和醫學院，有先進的實驗室和重點學科。有醫學分子生物學實驗室、分子腫瘤學實驗室、實驗血液學實驗室、病毒基因工程實驗室等多個國家級重點實驗室、國家臨床醫學研究中心5 個、其他國家級科研基地12 個、省部級實驗室53 個等。
健全的教學基地：
學校還十分重視國際化教學， 與近20個國家（地區）的醫學院校和科研機構建立起學術交流和科技、教育、醫療合作關係，成立了９個世界衛生組織合作中心，並已成為國際生物醫學研究高層組織（HIROS）成員單位。還與美國哈佛大學醫學院、美國加州大學舊金山分校醫學院、香港中文大學醫學院簽訂了校際交流的協議，互相交換高年級學生到對方學校進行短期臨床學習。
