對於飼料或飼料原料的發酵，我們無外乎想要達到兩個目的，一個是實現原料的飼用價值的維持，進一步是實現原料或飼料飼用價值的提高，這樣我們就可以將飼料發酵劃分為保值型發酵和增值型發酵兩個型別。當然，在飼料發酵過程中，伴隨著複雜的生化反應和複雜的物質變化，因而存在著不同飼用價值評價指標的起伏，保值與增值難以實現精確的區分。此外，針對於不同養殖動物、養殖階段或養殖目的，在不同評價方法下的同一指標可能分別被認為是減值、保值、增值。
首先說一下保值型發酵：最典型的保值型發酵就是青貯，透過厭氧狀態下發酵產酸，減少原料外觀、口感、營養物及其可消化性的損失與下降。當然在青貯過程中也伴隨有能量、蛋白、維生素等物質的少量損失，但這些與乾燥相比是完全可以接受的。有物質損失的同時，也有新物質的產生，包括多種有機酸、乳酸菌體及部分具有營養性與非營養性功能的代謝產物，大多情況下青貯發酵後，飼餵效果還要較青貯前的青綠狀態要好一些。在這裡我們簡單的將不經發酵或乾燥極容易喪失飼用價值的原料的發酵，劃入保值型發酵之中，比如鮮果渣、豆渣、薯渣、酒糟等的發酵都應該屬於這個型別。目前，保值型發酵絕大部分是做厭氧發酵，其主要優勢是操作簡單、能量損失小、易於操作、發酵風險低。
再說增值型發酵：這方面的例子比較多，沒有青貯對於保值型發酵那麼典型，但發酵豆粕仍可作為一個案例去講。透過好氧+厭氧發酵，提高了普通豆粕營養物的可消化性、同時賦予原料一部分產酶菌種和產酸菌種菌體本身及其代謝產物所帶來營養性及非營養性功能，提高了原料的整體飼用價值。對於單純厭氧發酵，部分飼料廠做的發酵麩皮也可以作為案例之一，透過將幹麩皮加水加菌發酵後加入到飼料之中，滿足了飼料保水需求，更能夠替代大部分的微生態製劑的功能。簡單來看，絕大部分非常規幹飼料原料的發酵，都可以劃分到增值性發酵的範疇之中。特別要說一下的是黃貯，黃貯發酵劃分入增值型發酵可能更合適一些。對於增值型發酵，可以採用的發酵方式就比較多了，好氧發酵、厭氧發酵、好氧+厭氧發酵等模式都可以採用。
談一個極端的例子，利用糖蜜或其他含糖副產物液體發酵酵母生產真菌單細胞蛋白，或者利用天然氣等發酵甲烷氧化菌生產細菌單細胞蛋白，以及類似的發酵產品，雖然發酵生產的產品絕大部分被用於飼料原料，也可以被認為是增值型發酵，但是這些液體發酵技術難度和工藝工業化程度非常高，難以劃分入農業或飼料發酵中，在討論飼料發酵時可以不把他們納入談論中。
