01
Plant Biotechnol J ：Transgene Killer CRISPR：簡單且快捷地得到無轉基因元件的多基因突變體
從遺傳學上闡明基因家族的功能通常需要同時破壞幾個基因以去除多餘的部分。基於CRISPR/Cas9的基因編輯技術可以同時敲除多個目標基因，但靶基因被編輯之後去除基因編輯DNA元件尤為必要。11月2日，來自華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室和國家植物基因研究中心的楊寧等人在Plant Biotechnol J上發表了題為“Editing Gene Families by CRISPR/Cas9: Accelerating the Isolation of Multiple Transgene-Free Null Mutant Combinations with Much Reduced Labor-intensive Analysis”的文章，描述了一種由團隊開發的TKC(Transgene Killer CRISPR)技術，精簡了多基因編輯的後續篩選工作。透過TKC的兩組自殺元件以及gRNA轉錄單元的串聯組合，只需要直接挑選轉基因植株的少量自交後代進行基因型檢測即可得到多種非轉基因的功能缺失突變組合，這項技術在很多基因上得到了驗證，並確實能夠大幅提高分析效率。
論文連結：
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.13744
DOI：
10.1111/pbi.13744
02
PNAS：翼龍肌肉發達的翼身連線處為它們提供多方面的飛行效能優勢
翼龍是最早的脊椎動物飛行動物， 然而，我麼對它們的飛行解剖結構和飛行效能方面還不甚瞭解。11月2日，來自香港大學地球與行星科學研究部脊椎動物古生物學實驗室的Michael Pittman等在PNAS上發表了題為“Pterosaurs evolved a muscular wing-body junction providing multifaceted flight performance benefits: Advanced aerodynamic smoothing, sophisticated wing root control, and wing force generation”的文章，透過使用極光刺激熒光，觀察到了翼龍連線處的軟組織證據，這一特徵可以減少平滑翼和身體的連線處的阻力，像現代飛行動物一樣。但與蝙蝠和鳥類不同的是，翼龍翼根連線處主要由肌肉組成。這項研究強調了使用新技術手段來填補翼龍飛行解剖學和進化方面的知識空白的價值。
論文連結：
https://www.pnas.org/content/118/44/e2107631118.long
DOI：
10.1073/pnas.2107631118
03
Plant Physiology：植物如何保護自己免受紫外線 B 輻射壓力
對於植物來說， UV-B 是一種環境訊號和影響發育和適應行為的潛在非生物因素。UV-B 調節光形態發生，包括抑制下胚軸伸長、子葉擴張和類黃酮積累，但高強度 UV-B 也可以破壞 DNA、引發活性氧的積累和損害光合作用。那麼植物如何保護自己免受UV-B的輻射壓力呢？11月3日，來自中國科學院植物分子遺傳學國家重點實驗室等的石晨、劉洪濤在Plant Physiology上發表了題為“How plants protect themselves from ultraviolet-B radiation stress”的文章，指出植物已經進化出了產生“防曬”的類黃酮類物質的能力。該文章總結了UVR8有關的途徑和ELONGATED HYPOCOTYL 5、BRI1-EMS-SUPPRESSOR1、MYB DOMAIN PROTEIN 13、MAP KINASE PHOSPHATASE 1 和 ATM-和RAD3等途徑的作用，並更新了UV-B應力耐受途徑的工作模型。
論文連結：
https://www.pnas.org/content/118/44/e2107631118.long
DOI：
10.1073/pnas.2107631118
04
PNAS：草莓的進化歷史和泛基因組學
草莓（Fragaria spp.）近年來已成為各種基礎和應用研究的模型系統。11月9日，來自雲南農業學院的喬琴等在PNAS上發表了題為“Evolutionary history and pan-genome dynamics of strawberry (Fragaria spp.)”的文章。作者報告了五個草莓物種的染色體規模參考基因組，包括三個新測序物種的基因組，以及 128 個額外種質的基因組重測序資料，以估計關鍵草莓物種的遺傳多樣性、結構和植物群歷史。最後，作者為草莓構建了一個泛基因組並檢查了基因家族的進化方向，並確定了與果實顏色相關的 MYB10 基因的多個單鹼基突變。這些參考基因組和資料集，可以與我們的系統發育分析相結合，最終成為未來草莓研究的強大比較基因組平臺。
論文連結：
https://www.pnas.org/content/118/45/e2105431118.long
DOI：
10.1073/pnas.2105431118
05
Nucleic Acids Research：DDInter：用於改善臨床決策和患者安全的線上藥物相互作用資料庫
藥物相互作用(DDI)可能引發患者許多不良反應，是對醫學和公共衛生的一個威脅。為了方便臨床醫生篩選危險藥物組合並改善衛生系統並整合具有臨床意義的資訊，來自中南大學湘雅醫院藥學部的研究團隊釋出了DDInter資料庫。目前，DDInter 包含大約 24 萬個相互作用對，覆蓋了1833個FDA批准藥物（1972 個條目），每種藥物都標註有基本的化學和藥理資訊及其相互作用網路，對於 DDI 條目也提供了豐富而專業的註釋，包括嚴重性、機制描述、管理潛在副作用的策略、替代藥物等，同時還有處方檢查功能。可透過該連結免費訪問：http://ddinter.scbdd.com/。該成果於10月11日發表於Nucleic Acids Research。
論文連結：
https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkab880/6389535
DOI：
10.1093/nar/gkab880
