醫源遠流長，發展至今，苗家醫藥已經有三、四千年的歷史。苗族的醫藥常常與神秘、神奇這樣的詞彙聯絡在一起，自成體系，尤以其內病外治的療法聞名中外，成為民族醫藥的一枝奇葩。苗族民間還有“千年苗醫，萬年苗藥”之說。有神農“嘗百草、識藥效，除病痛，始創醫學”；“蚩尤傳神藥、醫治百病”；“祝融傳熟食，傳按摩強身健體術”；“歡究傳丹砂、消疫除瘟”；“苗父藥到病除，神傳疾解”；“藥王餐風露宿尋找藥方，傳承‘三千苗藥，八百單方’”的苗醫遠古原始醫藥歷史。
苗族人民在長期的生產活動和與疾病、傷害作鬥爭的實踐中，積累了豐富的、寶貴的醫療經驗，成為我國傳統醫藥寶庫中的一部分。苗醫對病因的認知和對疾病的命名、分類等，皆具有濃厚的民族特色。
苗醫用藥多是植物藥、動物藥及少量礦物藥。藥的特徵歸納起來有熱、冷和不熱不冷三種；熱藥可治冷病，冷藥可治熱病，和藥可補體質、治虧損病。藥物的“結構素質”決定藥力及藥性：“質粘者易消化，補氣力，清頭腦；質糯者難消化，強筋生血，易傷肚；質沙者好吃，補血肉，和血脈，較難消化，容易產生多屁；質面者餬口，補肉補氣，利關節，較易消化，多食令人胃弱.
苗醫藥是苗族在生產生活中的智慧結晶，是千百年來的為苗族繁衍生息做出過巨大貢獻的保健醫療技術，更是在實踐經驗的基礎上總結髮展起來的生命科學。
它是苗族文化的瑰寶，滲透在苗族人生活習俗的方方面面，反映了苗族人對待天地的自然生命觀；
苗醫藥更是由苗族原創的具有自主產權的醫藥學體系，有著巨大的、潛在的經濟價值，是中華民族中醫文化寶庫的重要組成部分。
歷史上由於戰爭遷徙，苗族先民逐漸遺失了古苗文，苗族醫藥主要依靠家學、口傳身授或宗教儀式的方式進行傳承。它的診療、本草、方藥通過歷代薪火相傳，至今仍有很強臨床應用活力。
特殊的傳承方式，使苗醫藥蒙上神秘的色彩，至今相當多苗族民間藥方的特殊功效，難以用已掌握的現代西醫理論解釋。也是這種原因，苗醫藥在西醫藥的衝擊下被邊緣化，沒有得到學術界的重視。如此長期下去，必然造成苗醫藥人才流失，逐漸衰落。加快苗醫藥的發展，搶救千百年才形成的苗醫藥文化，發揮苗醫藥原創優勢、推動我國生命科學實現創新突破，對弘揚中華優秀傳統文化、增強民族自信和文化自信，造福人類具有重要意義。
