容器苗生產的優點是移栽時候不需要大量斷根，但它也有缺點。如果一棵樹木在容器裡面生長時間過長，其根系因為不能往外伸展，很容易便長出“盤根現象”，造成種後倒伏。由此可見，容器苗只有很短的“貨架壽命”(SHELF LIFE)，必須在根系長滿之時進行移栽，以免產出“盤根現象”。所以育苗容器的選擇很重要。
容器的尺寸、材質、顏色、牢固度、使用期、形狀、排水透氣性等因素都對苗木的生長有影響。
1.尺寸
容器的尺寸要根據苗木的生長情況和產品定位來更換，不能過大也不能過小。比如紅葉石楠新扦插成活的小苗，一般會選擇用12x10或者13x2釐米的營養缽週轉。因為這種苗是工程專用苗，所以在營養缽生長到4個月左右，就可以銷售了。如果苗子有滯留，營養缽已經不能在繼續生長，應換成1加侖盆。容器過大或過小都是浪費，一般苗子可以在合適的容器中過度一下，等長大合適大小再換盆也不遲。如果用加侖盆栽種苗子的話，一年就要換一次盆，如果是美植袋一類可以控根的容器則可以撐得久一些。
2.顏色
容器的顏色對苗木生長的影響，最主要表現在夏季。如果是黑色容器，在夏天的時候，暴露在太陽光之下的話，其中的介質溫度可能會超過48度，而如果是白色容器的話，則可以適當降低介質的溫度。不過，白色容器抗紫外線能力比較弱，使用壽命沒有黑色容器長。而且白色容器顏色很淺，在介質外圍生長的藻類會降低促進根生長的氧氣含量。所以，一般還是選擇黑色容器比較好。選用黑色容器，夏季遮陰的工作就要做好。
3.材質
穴盤：育苗階段通常用穴盤作為播種和扦插繁殖的容器，穴盤一般為塑膠材質。其主要特點是成本低、可重複使用、操作方便。
加侖盆：現代容器苗生產栽培上應用最為廣泛的當屬黑色塑膠加侖盆，簡稱加侖盆，一般注塑或吹塑工藝製成。國內一般採用美式標準換算，1加侖約為3.785L。生產上使用的有1、2、3、5、7、10、15、20加侖等多種規格，適合於中小型容器苗的生產。容器壁有獨特的條狀凹凸側稜，可有效防止盤根，有利於苗木的根系生長；作為生產用轉用盆，可迴圈使用。
美植袋：美植袋又稱無紡布袋，採用合成纖維針剌無紡布製作，經裁剪、縫紉，可生產出各種大小尺寸不一的規格。另外，根據無紡布本身的織物密度還有不同的單平米重量選擇。美植袋種植的苗木移栽成活率高，適用於大多數園林苗木的栽培，如喬木、灌木、竹類、棕櫚類植物等，移栽後無緩苗期，一旦入地就爆發性生根，同時地上部分也會生長迅猛。但是仍要注意在雨水多的季節，美植袋底部容易發生積水的可能。可以預先在底部四周打孔，或者增強底部介質的排水性來解決。否則易發生積水漚根的現象，導致美植袋周圍長滿藻類植物。
控根容器：大型植物控根容器由多塊控根容器片組成，可自由拆裝，並根據苗木的大小拼接圍成所需要的尺寸，適合中、大型苗木的栽培。還有另外一種專門用於防盤根的小型容器，美國許多喬木苗圃在培育小苗時使用，主要是長直根，避免根系纏繞，將來移植到土中就不會有盤根現象。目前，控根容器片有無紡布和塑膠兩種材料。
園藝盆：適用於各種植物的種植。可用於庭院、家庭、商務和酒店等各種場所擺放，美化環境，配上綠植，提升整體檔次。園藝盆有水泥盆、陶瓷盆、玻璃鋼花盆和PP或HDPE材料塑膠花盆等型別。水泥盆、陶瓷盆等傳統花盆厚重，成本低，受到不少國人的喜愛。近年，塑膠花盆因其款式多樣、外形美觀、 自身輕便、壽命長、不易破損等優點逐漸被國人喜歡，這也將是未來市場的新寵。園藝盆便於植物移栽，節約成本；外貿出口，價效比更高。在發達國家，園藝盆直接應用於生產，一步到位，不需要二次換盆，節省了成本。
盆套盆：盆套盆一般是用在喬木與大灌木的栽培，可以解決栽培這類苗木時常見兩類問題：第一 是苗木倒伏問題；第二 是地表容器內的根部在冬季易受凍害，尤其在北方，而夏季容器內溫度過高會燒根。盆套盆用的外盆埋在土內，不移動，內盆就是一般的栽培容器。內盆正好套在外盆內。外盆也有特殊的設計，外盆的底部漏水口會比較高，可以讓水分聚集在底部。因為根部是不會長到水裡去的，用這個方法可以防止根部盤繞。
和塑膠材質的加侖盆和種植袋類容器相比，無紡布容器即使受到太陽直射，溫度的變化也不是非常大，因此更有利於苗木生長。而且無紡布的透氣性比塑膠材質好，有利於苗木根系的生長。無紡袋透過空氣斷根，避免了盤根發生，根系指數更高，根系更發達。定植時不用去除無紡袋，上下劃破三至五個口即可。不過無紡布需要增加灌溉頻率，防止苗木缺水。
育苗容器應該如何選擇？
1.根據苗木規格選擇
苗木的規格要與容器的尺寸大小相匹配，同時，還要兼顧容器的承重能力和牢固程度，方便以後的搬運工作。一般在植株換盆前，首先要根據苗木的大小來確定所選擇的容器。剛剛扦插成活的小苗可選擇營養缽、1加侖的加侖盆；大苗的選擇餘地稍大一些，可以選擇加侖盆、美植袋、控根容器等。
2.根據生產期長短選擇
苗圃管理者要根據生產計劃選擇不同尺寸大小的容器以滿足不同出圃時間的要求。而且容器苗木的栽培週期相對較長，又是在露天條件下生產，需要容器有很好的抗老化效能。對於紫外線強、溫度變化劇烈的地區，尤其需要選擇使用期限長的容器。
3.根據產品培養方向選擇
工程用苗的培養一般選擇加侖盆、 美植袋容器為主。大型苗木選擇大型容器，可大到300加侖以上；或控根容器，便於操作，移栽時脫去容器直接栽植即可。造林苗木一般用輕質網袋進行播種和扦插繁殖，出圃後直接栽種，不用再移除外層網袋，方便快捷。銷往花園中心或其他家庭園藝方向的產品則可選擇紅陶盆、木箱、彩色加侖盆等有一定裝飾作用的花盆。
4.根據容器特性選擇
同樣的介質條件，矮胖型容器可以保持較多的水分，瘦高型容器則有更好的透氣性。對喜溼的苗木可以選擇矮胖型的容器;對喜乾的苗木，除了選擇顆粒更粗、排水性更好的介質之外，還可以選擇瘦高型容器。同時，一些容器還可以根據要求訂製，來滿足不同的種植需求。比如，可以透過改變加侖盆的排水孔位置和數量來增加它的排水透氣性。美植袋可以根據要求縫製成各種規格，也可根據承重量，增加2 ~4個拉手，方便轉移和搬運。
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