古人發現，每隔二十年，木星和土星就會相會一次。每過六十年，木星、土星和水星就會相會一次，也就到三星連珠。每過一百八十年，太陽系的九大行星就會同時執行到太陽的一邊，並且處於一定的角度範圍內，被稱為“九星連珠”。這些行星和地球與太陽的角度發生變化時，對地球上的生物以及氣場都會產生較大的影響。
於是人們就把木星和土星相會一次的時間定為一運；
把木星、土星和水星三星相會一次的時間定為一元；
把九星相會的時間定為一個“正元”。
也就是說每二十年為一運，三個二十年為一元，三元組成一個正元，為一百八十年，對應著行星相會的時間。
一個正元分為上元、中元和下元，一元又分為一運、二運和三運，這就是三元九運。
雖然每一運都代表著木星和土星相會一次，但是整個太陽系都在繞著銀河系執行，因此木星和土星每一次相會的時候，力量都不一樣，就是因為太陽系在銀河系中的位置發生了改變。
對於地球來說，木星和土星相會時，對各種生物的影響最大，除此之外，北斗九星對地球上的生物也會有影響，於是人們就把北斗九星與九大行星的執行規律相互結合，每一星對應一運，從而形成了獨特的“三元九運”概念。
