銀河帝國正在一步步走向覆滅。在這個龐大的帝國衰落了數個世紀後，人們終於開始覺察到這個事實。哈里•謝頓獨創了心理史學，描繪出社會與經濟發展的趨勢，預言了銀河帝國即將滅亡。同時，他利用心理史學，準確地計算出要經歷三萬年的蠻荒期，另一個嶄新的帝國才會從廢墟中誕生。為了縮短過渡時間，減少戰亂帶給人們的傷痛，謝頓建立了兩個基地，分別位於“星空中兩個遙相對峙的端點”
一、基地
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“謝頓博士，能否請您再說一遍對川陀未來的看法？”
答：“我已經說過了，三個世紀之內，川陀將變成一片廢墟。”
謝頓因為自己關於川陀即將毀滅的言論，正站在審判席上，受到公共委員會的委員質問。即使面對著可能的死刑的危險，謝頓也堅稱川陀將覆滅，甚至整個銀河帝國也將不復存在。他提出要編寫一部名叫《銀河百科全書》的書籍。它將準確地記錄銀河歷史上所有的知識，使動亂中的人類文明得以儲存。藉此將帝國毀滅的影響降到最低。出於這個崇高的理想的追求，近十萬人成為了他的追隨者。
考慮到謝頓的聲望，為了避免可能導致的混亂，公共委員會的陳主任不敢處死謝頓。他同意讓謝頓帶著他的十萬人去銀河帝國邊緣的一個名叫端點星的地方，在那裡他們可以自由編撰《銀河百科全書》。事實上，陳主任的每一步行動早已被心理史學分析透徹，這恰恰是謝頓心中建立第一基地最完美的星球。
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五十年過去了，謝頓早已去世，端點星形成了完善的制度，《銀河百科全書》的編撰工作也已經完成。這部銀河歷史上歷史最偉大的鉅著第一冊即將出版，以後每十年將出版下一冊。與此同時，基地也成為了銀河外圍科技最發達的地方。
危機還是來臨了：基地附近的安納克里昂星郡的皇家總督自立為王。基地的金屬資源十分貧瘠，這直接切斷了基地的金屬供應。並且，該王國打算直接武力佔領基地，擴大自己的領地。基地最大的優勢是擁有銀河外圍已經失去的核能，這是基地周圍的四個王國都缺乏且覬覦的。基地的首任市長塞佛•哈定運用自己的智慧，利用基地周圍四個王國之間的相互制衡穩住了局勢。
隨後，市長哈定借宗教的外衣來傳播核能科技，使四王國出現了無數的教士，宗教成為了事實上絕對的權威。當安納克里昂星郡的國王覺得自己的軍力已足夠攻下基地，準備發動攻擊時，他卻發現自己的所有的力量早已被基地以宗教的形式所控制。從此，基地再也不會受到四王國的威脅。
宗教成為了基地防禦的絕佳力量，但卻無法推動基地的擴充套件。隨著時間的推移，往返於各星系之間，販賣核能物品的“行商”站上了歷史的舞臺。一些王國受宗教影響，將核能看作邪惡的力量加以排斥。行商以核能科技所帶來的利益讓王國的領導層首先接受了核能，藉此使整個王國也逐漸接受核能科技。基地的商業版圖不斷擴大，得到了自己發展所需要的各種資源，科技進步更加迅速，悄然發展著屬於自己的力量……
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行商長侯伯•馬洛是行商中的領軍人物，他成功地與科瑞爾共和國建立了貿易合約，同時也發現了銀河帝國的力量已經滲入到了這個這個位於銀河帝國邊緣的王國。
返回基地後，馬洛用自己的智慧經歷了不斷的政治鬥爭，以行商的身份獲得了基地領導者的權利。這時，獲得銀河帝國軍事援助的科瑞爾共和國野心愈發膨脹，想要武力掠奪基地積累的龐大財富。
馬洛一如既往地向科瑞爾共和國販賣商品，彷彿並沒有意識到危險的發生，他的無所作為受到了基地民眾的反對與批評。但事實上，行商提供給科瑞爾共和國的商品早已控制了該國的經濟命脈。一旦行商不向該國出售並維修商品，科瑞爾共和國將立刻陷入癱瘓。因此，科瑞爾共和國除束手就擒別無他法。
二、基地與帝國
經過了四十年的擴張，基地
終於直面里歐思的威脅。哈定與馬洛的英雄時代一去不返，基地人民的勇敢與果斷的精神也隨之式微……
——《銀河百科全書》
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貝爾•里歐思是銀河帝國如今的一位年輕善戰的將軍，深受士兵的愛戴，年紀輕輕便功勳卓著。
他聽說了謝頓想要透過基地建立第二帝國的故事，但並沒有認為這個想法是異想天開，反而覺得帝國將因此受到威脅。出於軍人的職責，他選擇了以自己的戰艦攻擊基地。如今，基地的武力仍然無法與帝國這具龐然大物相提並論，但基地已無路可退、無處可逃。
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戰局逐漸白熱化。雖然基地的星艦都奮勇作戰，沒有絲毫退縮，但他們相對落後的武器還是很難抵擋帝國的強大軍力。眼看基地即將被攻陷，謝頓計劃危在旦夕。而恰恰這時，被克里昂二世派來監軍的寵臣布洛綴克受到迪伐斯的誤導，認為基地有可以將廉價的鐵變成極為昂貴的銥的核科技。因而，他在巨大的利益驅動下，也開始極力主張進攻基地。這引起了一向強勢的皇帝克里昂二世的猜忌。里歐思在即將得勝之時，被克里昂二世召回，隨即被以謀反罪處死。基地轉危為安。
事實上，這看似是一種偶然的情況，但在心理史學的分析下，這更多的是歷史的必然。克里昂二世這個強勢的皇帝怎麼可能允許自己手下強勢善戰的將軍功高震主呢？
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謝頓計劃中最大的變數出現了，“騾”登上了銀河歷史的舞臺。
騾的母親在生下他之後就死去了，他的父親同樣不知所終。騾的身體畸形，四肢骨瘦如柴，瘦削的臉龐幾乎被三英寸高的大鼻子全部遮蓋。由於從小孤苦無依，受他人冷眼相待，騾的心理愈發極端。然而，騾擁有因基因突變獲得的的強大精神異能，他能夠重塑他人思想。即使是血海深仇的敵手，他也能將其塑造成最忠心的奴僕。
當騾發現自己的力量後，征服銀河的野心逐漸產生，並一步步成為現實。憑藉著自己強大的精神異能，騾建立了屬於自己的卡爾根帝國並最終戰勝了基地。他計劃將基地當作一座兵工廠，成為自己征服銀河的武力後盾。基地被徹底攻陷，謝頓計劃被迫中斷。
然而，騾能夠征服銀河系嗎？謝頓的計劃是否就此終結，亦或騾作為個體永遠無法改變歷史的軌跡？謝頓的第二基地究竟在哪裡，它能夠阻止騾統一銀河嗎？
歷史的車輪還在永不停息地轉動，每一顆恆星依舊在閃耀著璀璨的光芒，銀河帝國與基地的故事仍在繼續……
